Laboratoire de biologie computationnelle et quantitative | LCQB
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Unité mixte de recherche
Le LCQB est un laboratoire interdisciplinaire travaillant à l'interface entre la biologie et les sciences quantitatives. Il est construit pour promouvoir une interaction équilibrée des approches théoriques et expérimentales en biologie et pour favoriser la définition de nouvelles questions expérimentales, l'analyse des données et la modélisation des phénomènes biologiques. Nos projets abordent des questions sur les structures et processus biologiques à travers la réalisation d’expériences de génomique fonctionnelle, d’ingénierie des génome et de biologie synthétique sur des organismes modèle (levure, micro-algue et bactérie), le séquençage des génomes, la génération in silico de nouvelles données biologiques qui restent aujourd'hui inaccessibles aux expériences, la modélisation mathématique et physique des systèmes biologiques, le développement de méthodes statistiques pour les données l'analyse, et la conception d'algorithmes originaux visant à des prédictions.
Équipes
- Analytical Genomics (Group Leader: Alessandra Carbone)
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Biology of Genomes (Group Leader: Gilles Fischer
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Evolution and immunology of pathogens (Group Leader: Igor Rouzine)
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Genetic Networks (Group Leader : Frederic Devaux)
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Mathematical Modeling in Biology (Group Leader: Delphine Salort)
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Statistical Genomics and Biological Physics (Group Leader: Martin Weigt)
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Synthetic and Systems Biology of Microalgae (Group Leader: Stéphane Lemair)
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Telomere & Genome Stability (Group Leader: Zhou Xu)
Direction
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Alessandra Carbone
Direction adjointe
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Gilles Fischer
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Martin Weigt
Administration
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Mylène Jomie
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+33 1 44 27 73 38
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Fabienne Velter
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+33 1 44 27 20 67
Communication
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Fabienne Velter
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+33 1 44 27 20 67
Tutelle hébergeante
- Sorbonne Université
Autres tutelles
- Centre National de la Recherche Scientifique | CNRS
58 membres
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Enseignants-chercheurs : 18
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Chercheurs : 4
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Personnels d'appui à la recherche : 1
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Doctorants : 19
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Post-doctorants : 7
- Microfluidic single cell microscopy
- OXford Nanopore Sequencing
- Pulse-field gel electrophoresis
- Microdissecator
- Microalga culture room
- Computer cluster
- Logiciels
Publications
Publications sur HAL - Archive ouverte
Toutes les publications sur HALPCM-LLM: Bridging Non-Verbal Consciousness Modeling and Language Processing to Make Intelligent Social Virtual Agents Closer to Human Beings
Tonglin Yan, Grégoire Sergeant-Perthuis, Kenneth Williford, David Rudrauf
ASSC28, Jul 2025, Crete, Greece. ⟨hal-05146878⟩
Transcriptional landscape of the cell cycle in a model thermoacidophilic archaeon reveals similarities to eukaryotes
Miguel Gomez-Raya-Vilanova, Jérôme Teulière, Sofia Medvedeva, Yuping Dai, Eduardo Corel, Philippe Lopez, François-Joseph Lapointe, Debashish Bhattacharya, Louis-Patrick Haraoui, Elodie Turc, Marc Monot, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Eric Bapteste, Mart Krupovic
Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.5697. ⟨10.1038/s41467-025-60613-8⟩. ⟨pasteur-05141107⟩
Dynamic Relocalization and Divergent Expression of a Major Facilitator Carrier Subfamily in Diatoms
Shun Liu, Victoria Powell, Shun‐min Yang, France Lam, Chris Bowler, Miroslav Obornik, Richard G Dorrell
Physiologia Plantarum, 2025, 177 (3), pp.e70355. ⟨10.1111/ppl.70355⟩. ⟨hal-05134059⟩
Rapid cell turnover to model adipocyte size distribution
Louis Fostier, Aloïs Dauger, Romain Yvinec, Magali Ribot, Chloe Audebert, Hédi Soula
2025. ⟨hal-05105900⟩
Contact details
Adresse physique
75005 Paris
Adresse postale
75005 PARIS
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+33 1 44 27 42 52
Institut de Biologie Paris Seine
Sorbonne Université
Bâtiment C, 3ème et 4ème étages
7-9 Quai Saint Bernard 75005 Paris